Выяснилось, что давно обнажившаяся верхняя часть головы и спина трупа сильно повреждены волками, отсутствовали мягкие ткани на голове и хобот. Раскопки начали с удаления бугра земли, окружавшего остальную часть туши. Мёрзлый грунт почти не поддавался кирке и лопате. Чтобы он оттаял, над местом работ был сооружён бревенчатый сруб, который круглосуточно отапливался специальными печами. Постепенно труп мамонта обнажался, при этом с большей части кожи облезала шерсть. Поза зверя была необычна: он лежал на брюхе с вытянутыми вперёд задними конечностями, передние конечности были также вытянуты вперёд и полусогнуты в локтевых и запястных суставах.
Оказалось, что мамонт имел прижизненные переломы костей таза и плеча. По-видимому, смерть зверя наступила внезапно, в ротовой полости сохранились непережёванные остатки пищи — пучки травы. Многие растения уже имели семена, поэтому временем гибели животного считается конец лета.
Очищенный от грунта труп мамонта был расчленён на несколько частей, каждая из которых заворачивалась в холстину, а затем зашивалась в конские шкуры. Тюки с частями тела мамонта выносились на воздух, где они вновь замерзали. Тяжелый груз вывозили на лошадях и оленьих упряжках. В феврале 1902 г. экспедиционный транспорт прибыл в Иркутск, и отсюда в вагоне-рефрижераторе труп мамонта был отправлен в Петербург (Герц, 1902).
В 1903 г. в Зоологическом музее Академии наук было выставлено для обозрения чучело Берёзовского мамонта — уникальный экспонат, подобного которому нет ни в одном музее мира. Искусством препараторов-таксидермистов животному была сохранена поза, в которой оно было найдено, заделаны повреждения, нанесённые туше хищниками. Уже в 60-х годах 20-го века с помощью радиоуглеродного анализа был установлен абсолютный возраст Берёзовского мамонта — он погиб 44 тысячи лет назад (вкл. 2).
Большинство скелетов с остатками мягких тканей, найденные в вечной мерзлоте Сибири, находятся в отечественных музеях, однако есть одно исключение — это остатки трупа мамонта, найденного на острове Большой Ляховский в 1906 г. В настоящее время его скелет экспонируется в Национальном музее естественной истории в Париже (Франция).
История находки в основном изложена в статье К. А. Воллосовича (1915). Летом 1906 г. промышленник А. Горохов обнаружил на дне ручья в долине р. Этериканка, в 20 км выше места ее впадения в р. Большой Этерикан, на северо-востоке о. Б. Ляховский, голову мамонта в коже, с хоботом и двухпудовым правым бивнем. Горохов выломал бивень и отрубил кусок хобота (впоследствии они были утеряны). Информация о находке была передана геологу Воллосовичу, участвовавшему в 1908 г. в раскопках трупа мамонта на реке Санга-Юрях, организованных Академией наук. Он предложил местным промышленникам отправиться на о. Б. Ляховский летом 1908 г. и разыскать стоянку Горохова (к тому времени умершего), возле которой, вероятно, и был обнаружен мамонт. Уже в декабре 1908 г. Воллосович получил известие от поисковой группы, что мамонт найден. Он обратился за финансовой помощью в Российскую академию наук к академику Ф. Б. Шмидту, который, однако, отказал ему под тем предлогом, что интерес к мамонтам (после находок на pp. Берёзовка и Санга-Юрях) ослабел, и поэтому деньги на раскопки не получить. Тогда Воллосович, понимавший, что найден прекрасно сохранившийся труп мамонта, обратился к графу А. В. Стенбок-Фермору, который, не раздумывая, предоставил деньги на необходимые изыскания. Летом 1909 г. и весной 1910 г. группа промышленников по поручению Воллосовича раскопала остатки мамонта. Были добыты четыре ноги, большая часть скелета, куски кожи (в том числе с ухом, глазницей и хвостом) и куски мышц с жиром. Часть мягких тканей была оставлена в ледяном погребе около места находки, а наиболее ценные части трупа и кости были вывезены весной 1910 г. в Якутск и далее в пригород Санкт-Петербурга, пос. Лахта, где была проведена специальная обработка и препарирование этого материала, частично пострадавшего в пути.
В 1912 г. ляховский мамонт был подарен А. В. Стенбок-Фермором правительству Франции, за что он был якобы удостоен «Ордена Почетного Легиона» (французские коллеги не смогли найти этому подтверждения), а российская наука и Зоологический музей Академии наук лишились ценнейшего экспоната. Скелет был смонтирован в Национальном музее естественной истории в Париже, часть мягких тканей передана другим парижским музеям, а некоторые и вовсе утрачены (одна из задних ног). Руководство Российской академии наук, вероятно, осознало допущенную ошибку и уже в 1913 г. профинансировало экспедицию Кутоманова на Таймыр за скелетом мамонта, который оказался гораздо худшей сохранности.
Французские учёные поначалу проявили большой интерес к подаренному уникальному экспонату, а позднее писали о нем только в связи с перемонтажом скелета. Интересно отметить, что примерно в те же годы, когда был доставлен в Париж скелет ляховского мамонта, во Франции был найден и смонтирован в Булонском музее (Bouloqne Museum) почти полный скелет мамонта из долины реки Аа (de l'Aa).
Следующая, сенсационная по сохранности находка мамонта, была сделана уже только в 1977 г. в верховьях Колымы на территории Магаданской области. В июне бригада старателей подготавливала площадку для промывки золота в долине ручья Киргилях. Участки мёрзлого грунта, затруднявшие работу, оттаивали с помощью воды ручья, направляя её в нужную сторону. В одной из мерзлотных линз нож бульдозера зацепил труп мамонтёнка. Бульдозерист А. В. Логачев остановил работу, тело зверя было извлечено из грунта и сохранено до приезда учёных.